Program studi Fakultas Ekonomi Universitas Hindu Indonesia terdiri dari 2 (dua) program studi, yaitu Program Studi Manajemen dan Program Studi Akuntansi dengan SK Menteri P dan K no. 75/D/O/1993. Program Studi Manajemen Fakultas Ekonomi UNHI pada tahun 2002 telah diakreditasi oleh BAN DIKTI dengan nilai C berdasarkan SK BAN Perguruan Tinggi Departemen Pendidikan Nasional Republik Indonesia nomor 004/BAN-PT/Ak-V/S1/IV/2002. Dengan nilai C berarti jangka waktu untuk penilaian kembali hanya dalam jangka waktu 3 tahun. Akreditasi yang kedua diajukan tahun 2006 dan hasil evaluasi dari Tim BAN mendapatkan nilai B berdasarkan SK BAN Perguruan Tinggi Departemen Pendidikan Nasional Republik Indonesia nomor 017/BAN-PT/Ak-X/S1/X/2006.

Sejak awal bahwa pendidikan tinggi ekonomi yang harus dikembangkan di Bali dan Indonesia adalah berorientasikan kepada pembangunan, sehingga dalam perkembangannya selalu diusahakan agar lulusan Fak. Ekonomi UNHI mempunyai orientasi pembangunan Indonesia

Visi dan Misi

Visi

Menjadi fakultas ekonomi unggulan dan pusat pengkajian ilmu ekonomi berdasarkan nilai-nilai agama hindu berbasis TIK

Misi

1. Menciptakan Sumberdaya manusia Profesional dengan kompetensi tinggi
2. Meningkatkan Kualitas pendidikan Melalui pembelajaran dan penelitian berbasis TIK
3. Mewujudkan pengelolaan organisasi secara transparan dengan akuntabilitas tinggi mengacu pada standar yang berlaku

Tujuan

1. Menerapkan sistem pengelolaan SDM berbasis kompetensi
2. Menerapkan sistem pembelajaran sesuai dengan Standar Akreditasi Nasional
3. Menciptakan fakultas ekonomi sebagai pusat penelitian dan pengembangan ekonomi
4. Menerapkan sistem pengelolaan organisasi yang mengacu pada standar akreditas nasional